متن پیام یادگار امام به رییس جمهور سابق به این شرح است:
بسمه تعالی
سرور معظم حضرت حجه الاسلام و المسلمین اقای حاج سید محمد خاتمی دامت برکاته ضایعه مولمه درگذشت خواهر گرامی تان مادر شهید سعید حاجیه خانم سیده فاطمه خاتمی را
خدمت جنابعالی ، مادرگرامی و بزرگوارتان و اخوان و خواهران گرامی و همچنین خدمت بیت آیت الله خاتمی قدس سره الشریف تسلیت عرض نموده از خداوند متعال علو درجات ایشان و دوام توفیقات و طول عمر با عزت و سربلندی برای جنابعالی مسئلت دارم.
سید حسن خمینی