بنای مقبره به‌صورت هشت ضلعی است و در میان یک باغ قرار دارد. تزئینات و نقاشی‌های مقبره در دوران حکومت صفویان صورت گرفته است و در دوره‌های مختلف، بخش‌هایی به این بنای کهن افزوده‌اند. از دیگر تزئینات بنا می‌توان به گچ‌بری، مقرنس‌کاری و کاشی‌کاری اشاره کرد. با توجه به ارزش تاریخی و معماری، مقبره شیخ امین الدین جبرائیل در تاریخ ۱۵ دی ۱۳۱۰ با شماره ثبت ۶۵ به‌عنوان یکی از آثار ملی ایران به ثبت رسید.
