سرانجام مسئولان باشگاه پرسپولیس بعد از نزدیک به دو هفته مذاکره با گزینههای مختلف امروز به این نتیجه رسیدند که علی دایی بهترین گزینه برای هدایت این تیم در فصل آینده است.
محمد مایلی کهن، منصور ابراهیمزاده و حمید درخشان دیگر گزینههایی بودند که شانس نشستن روی نیمکت پرسپولیس را داشتند، اما در پایان دایی به عنوان سرمربی سرخپوشان انتخاب شد.
دایی در حالی به پرسپولیس میآید که چند روز پیش قرارداد سه ساله خود را با باشگاه راهآهن به صورت رسمی منعقد کرد و حتی در نشست خبری با حضور اصحاب رسانه و رییسی کیا - مدیرعامل این باشگاه از برنامههای خود برای این تیم در آینده صحبت کرد.
او حتی در اظهار نظرهای چند روز گذشته خود تاکید کرده بود که اصلا به پرسپولیس فکر نمیکند.
دایی، فوتبال را از باشگاههای کوچک شهر اردبیل همچون استقلال اردبیل و وشهرداری اردبیل آغاز کرد. او پس از قبولی در دانشگاه صنعتی شریف و اقامت در تهران، به تیم تاکسیرانی تهران، سپس به بانک تجارت پیوست و در این تیم بود که مورد توجه بیشتری قرار گرفت و برای اولین بار به تیم ملی دعوت شد.
دایی بعدها به پرسپولیس تهران و سپس السد قطر پیوست و از این تیم راهی اروپا شد و به باشگاه آلمانی آرمینیا بیلهفلد پیوست. مقصد بعدی او بایرن مونیخ آلمان بود.
او سپس به هرتا برلین پیوست و پیراهن شماره ۹ این تیم را بر تن کرد. دایی با هرتا برلین هم در جام باشگاههای اروپا بازی کرد و دو بار دروازهٔ چلسی و یکبار دروازهٔ آث میلان را گشود. علی دایی با باشگاه سایپا به عنوان بازیکن و سرمربی تیم سایپا، در سال ۱۳۸۵ فعالیت خود را آغاز کرد. این تیم توانست در خرداد ماه ۱۳۸۶ قهرمانی ششمین لیگ برتر را به دست آورد. او همزمان با قهرمانی سایپا در روز ۷ خرداد ۱۳۸۶، بازدن گل قهرمانی سایپا، که آخرین گل رسمی آقای گل جهان بود، از بازیگری در رشته فوتبال، در مقاطع رسمی، برای همیشه خداحافظی کرد.
او دوران مربیگری خود را به عنوان سرمربی و بازیکن در تیم سایپا شروع کرد و توانست این تیم را در لیگ برتر ایران (جام خلیج فارس) به قهرمانی برساند. او در تاریخ ۱۲ اسفند سال ۱۳۸۶ به عنوان سرمربی تیم ملی فوتبال ایران انتخاب شد او شب قبل از انتخاب سرمربی تیم ملی ادعا کرد: کسی لابی قوی تری داشته باشد سرمربی میشود. و خودش سرمربی شد. پس از شکست تیم ملی مقابل عربستان در ورزشگاه آزادی مسئولان فدراسیون فوتبال تصمیم گرفتند علی دایی را از سمت خود برکنار کنند. تیم ملی ایران در ۸ فروردین ۱۳۸۸ و در حضور ۱۰۰ هزار تماشاگر و رییس جمهور محمود احمدی نژاد، مقابل عربستان با نتیجه ۲ بر یک شکست خورد. در روز ۹ فروردین ۱۳۸۸ فدراسیون فوتبال طی بیانیهای رسماً علی دایی را از سمت خود برکنار کرد.
در روز ۷ دیماه سال ۸۸ وی رسماً از سوی مدیر عامل باشگاه فوتبال پرسپولیس تهران برای مدت یکسال و نیم به عنوان سرمربی پرسپولیس منصوب شد.
او در ۲۸ آذر ۱۳۸۹ از این سمت استعفا داد اما حبیب کاشانی سرپرست تیم پرسپولیس و کادر فنی و دیگر بازیکنان با استعفای او موافقت نکردند و با پافشاری فراوان و رفتن دسته جمعی به خانهی وی از او درخواست بازگشت کردند. علی دایی هم پذیرفت و روز بعد به تمرینهای تیم پرسپولیس بازگشت.
در تاریخ ۳۱ خرداد ۱۳۹۰ و پس از رد درخواست کمیتهی فنی باشگاه پرسپولیس مبنی بر ادامهی مربیگری پرسپولیس مشروط به اعلام "همکاری کامل" با حبیب کاشانی در فصل آینده؛ حمید استیلی توسط کمیته ی فنی به عنوان سرمربی انتخاب شد و دایی رسماً این باشگاه را ترک کرد. البته علی دایی اعلام کرده بود در صورتی در پرسپولیس میماند که مدیرعامل باشگاه از سوی هیات مدیره محترم برخوردار از وجاهت قانونی و قوانین جاری انتخاب شده باشد. از سپاهان به عنوان مقصد بعدی وی برای سرمربیگری نام برده میشد. اما با انتخاب لوکابوناچیچ به عنوان سرمربی سپاهان اصفهان مربی شدن علی دایی در سپاهان منتفی شد.علی دایی همراه با پرسپولیس در1سال و نیم حضورش 2 بار قهرمان جام حذفی شد در حالی که پرسپولیس در 9 سال گذشته تنها موفق به کسب 2 جام شده بود و همچنین بعد از 3 سال موفق شد پرسپولیس را پیروز از میدان داربی بیرون بیاورد.
وی در ۲۳ تیر ۱۳۹۰ به عنوان سرمربی تیم راهآهن که به بخش خصوصی واگذار شده انتخاب شد.